水資源回收中心之建設除可潔淨污染日益嚴重之客雅溪水質，杜絕蚊蟲滋生、改善環境衛生、提升漁業資源，還給新竹市民一個潔淨的親水生活空間外，並對居民生活品質將更有保障，使新竹市躍身成為國際性都市。本工程係屬統包工程，主要工程內容除了水資源回收中心外，尚包括17.2公頃海埔地造地工程。水資源回收中心共分四期興建，第一期工程設計平均日污水量為30,000CMD，全期將增加至130,000CMD，主要污水處理程序為活性污泥法＋砂濾處理。
 
本廠在尚未填土前，原地表高程約在EL.+1.5m ~ +2.5m左右，暴潮位EL.+3.5m；根據基本設計需求，廠區填土高程至+4.7m，高出暴潮位達1.2m。回填方式採封閉式圍堤，土方來源為本廠區北方之新竹漁港，平均運距約7.7公里，土質以粉質細砂為主；為避免填土區抽砂回填後，因地震引致土壤液化及填土區自體與原海床土層的壓縮沉陷，全部面積的砂質土層採用動力夯實，廠站區 更輔以擠壓砂樁工法改良地質，以符設計需求。