本工程長約3.557公里，包括興建台鐵地下化雙軌明挖覆蓋隧2.20公里、引道0.63公里及平面段0.727公里，其間並於民族路及大順路附近新設二處台鐵捷運化通勤車站－民族車站與大順車站。車站月台以180公尺長、5.2公尺寬設計，位於地下二層；上方為穿堂層，地面設主出入口一處，位於中央綠帶。其中民族車站以「微觀萬象」為建築設計主題，取物質微形元素—碳分子最基本之六邊形作為單元，組合成不同型式之樹狀結構作為出入口主架構；大順車站則以「生命密碼」為建築設計主題，以DNA螺旋體為主要構架，搭配弧面玻璃，展現「有鳳來儀、科學展翼」意象。